在進行微生物研究前，應為微生物的預備、加工、培養和棄置的每個程序設定安全措施，減少污染和潛在危險。

1. 任何人感到不適，便不應參與微生物研究。
2. 穿著實驗袍並戴上即棄手套。
3. 實驗室內不准飲食。
4. 避免用手接觸口部，如咬手指或咬筆桿。
5. 進行微生物研究之前和之後，都必須以肥皂徹底清潔雙手。
6. 進行微生物研究之前和之後，都必須以消毒劑清潔工作區域。
7. 所有培養物和儀器，在使用前都必須放入高壓滅菌器滅菌；
   所用使用工具，在使用前和使用後都要進行滅菌，金屬工具如接種環應以火燒滅菌，其他工具如移液管則以 70% 酒精噴灑；
   時刻封閉試管或燒瓶，打開或封閉時都應以火燒試管口或燒瓶口，切勿打開蓋子觀察活細菌。
8. 所有培養物和污染物放進高壓滅菌膠袋，進行高壓滅菌或焚化。
9. 切勿在 30 °C 以上培殖微生物，因為 30—40 ° 有助於能感染人類的病原體生長。不要從病原的潛在來源中抽取微生物，如土壤，肉類和廁所座位。
10. 向老師報告所有洩漏或打碎的意外，並以即棄抹布及消毒劑擦拭洩漏。